小笠原長清 は兄の秋山光朝と共に京で 平知盛 に仕えていたが、治承四年（１１８０）に 頼朝 挙兵の報を聞き、母の病気を口実にして甲斐に戻った。
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平治物語に拠れば、富士川合戦の前哨戦で 「甲斐源氏の 武田信義 ・ 一條忠頼 ・ 小笠原長清 ・ 逸見光長 ・ 板垣兼信 ・ 加賀美遠光 ・ 秋山光朝 ・ 浅利義成 ・ 石和信光 らが駿河目代（代官）広政（橘遠茂）を討った」とある。同様に吾妻鏡の１０月１４日も　「武田・安田の一行は神野と春田路を経て正午前後に鉢田に着いた。駿河目代の軍は狭い道で突然遭遇したため動きがとれず、防御に努めたが長田入道と子息の二人は討ち取られ橘遠茂は捕虜になった。後続の兵は悉く逃げ去り、午後６時前後には富士裾野の伊堤に討ち取った首を晒した。」 と書いており、甲斐源氏全体が互いに連携を保ちながら転戦していたのは間違いない。

右：小笠原長清 明野町と櫛形町の史蹟　　　画像をクリック→明細にリンク

吾妻鏡の数ヶ所には挙兵当初から頼朝が甲斐源氏を従えて平家と戦ったような表現が見られるが、実際には概ね対等の立場だった。寿永三年（1,184）１月の 木曽義仲 滅亡と翌年３月の平家滅亡を経て頼朝の動員力が強化され、幕府体制の組織整備が進むに従って甲斐源氏も弱体化し、更には一族内部の分裂などに伴って主力の武田信義や安田義定が滅び、甲斐源氏は東国の覇権を握った 頼朝の御家人として生き延びるか滅亡するかの選択を強いられることとなった。
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同じ甲斐源氏の武田信光、信濃の名族 海野幸氏 や 望月重隆 と並んで弓馬四天王と称された小笠原長清も、頼朝に従属する道を選んだ一人で、２６歳で頼朝の弓馬術礼法の師範となり鎌倉幕府御家人として一族発展の基礎を築いた。嫡流は甲斐から信濃国に伴野荘（佐久市・地図）に移り、更に１０ｋｍほど東の平賀郷 （地図）を新領として獲得、弘安八年（１２８５）の霜月騒動に関与して粛清されるまで繁栄を続けた。
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子孫は武芸礼法に長けた 小笠原流 (wiki) として発展し、現代に至っている。
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ちなみに、安土桃山時代に信州深志（松本）の城主で小笠原長時の孫に当たる小笠原貞頼（徳川家康の家臣）が小笠原諸島を発見したという伝承がある。

７０ｍ四方の土地が小笠原長清邸の跡である」と書かれているらしい。

小笠原長清が得意とし、弓馬術礼法小笠原流として現代に続いていることから小学校のシンボルに採用されたのだろう。

庶流が残った。旧地名は櫛形町、 ２００３年に八田村・白根町・芦安村・若草町・櫛形町・甲西町が合併して南アルプス市となった。

４月の御幸祭では神輿が下宮地の神部神社（地図）から上宮地の伝嗣院（地図）まで約４ｋｍを練り歩き途中の御所庭（長清館跡）で饗応の儀式を
儀式を行っていたが、小学校になった関係で現在は笠屋神社に立ち寄っている。延宝年間（１６７３〜１６８１）前後に建設された檜皮葺きの本殿は
老朽化が激しかったため昭和４２年に立て直されている。「的場」の地名も、弓馬礼法に長じた小笠原氏を連想させて面白い。

公祠堂は道路から引っ込んでいるため判りにくい。目印は「喫茶シェルブール」、横の路地を入って突き当たりにある。

清水寺近くに開いた長清寺に埋葬されたが応仁の乱（１４６７〜１４７７）の兵火で焼失して廃寺になった。
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後に子孫の丸毛長照が遺骨を掘り出して飯田市中村の臨済宗長清寺（地図）と開善寺（地図）、長照の本領・美濃赤坂の荘福寺（地図）に
分骨埋葬（分祀とも）した。その際に更に分骨埋葬したのが南アルプス市小笠原の山寺地区で、その墓地の跡が現在の長清公祠堂であり、
老朽化に伴って平成１５年に修復再建されている。

右手高みに墓地があり、五輪塔は本堂の反対側・左手奥に位置する。

肥前国唐津藩主長昌の長男）の子で海軍中将・正二位。忠知系小笠原家の第十四代。

本堂左にある大きな五輪塔（１．１ｍ）は昭和１４年に当時の住職と檀家が近くの畑から掘り出して境内に祀り、小さな五輪塔（０．９ｍ）は左手の
水田の中にあって「疣（いぼ）地蔵」と呼ばれていた物を昭和の末に移設したという。